ウイルス学的な研究の情報

新型コロナウイルスのウイルス学的な研究について

 ● Virological assessment of hospitalized patients with COVID-2019
  Nature Published: 01 April 2020
  … Extended data に抗体についての挙動(他のコロナウイルスとの交差性
   を示すもの)もあり。
 ● Site-specific glycan analysis of the SARS-CoV-2 spike
  Science 04 May 2020: eabb9983 DOI: 10.1126/science.abb9983
  … Sタンパクの糖鎖付加についての解析。

ウイルス-宿主関係

 ● Functional assessment of cell entry and receptor usage for SARS-CoV-2 and other lineage B betacoronaviruses
  Nature Microbiology volume 5, pages 562–569(2020)
  … SARS-CoV-2 の受容体は ACE2 であるという解析。
 ● SARS-CoV-2 entry factors are highly expressed in nasal epithelial cells together with innate immune genes
  Nature Medicine volume 26, pages681–687(2020)

変異などについて

 ● Emerging SARS-CoV-2 mutation hot spots include a novel RNA-dependent-RNA polymerase variant
  Journal of Translational Medicine volume 18, Article number: 179 (2020)
  … 変異しやすい部位には RdRp も含まれているという報告。

遺伝学的研究

 ● Emergence of genomic diversity and recurrent mutations in SARS-CoV-2
  Infection, Genetics and Evolution Available online 5 May 2020, 104351
  … SARS-CoV-2 の遺伝変異について。
 ● No evidence for distinct types in the evolution of SARS-CoV-2
  Virus Evolution, veaa034, https://doi.org/10.1093/ve/veaa034
  … ウイルスのタイプは特に分かれていないという検討。
 ● 新型コロナウイルスSARS-CoV-2のゲノム分子疫学調査
  国立感染症研究所 2020.4.27
 ● Phylogenetic analysis of nCoV-2019 genomes
 ● Emergence of genomic diversity and recurrent mutations in SARS-CoV-2
  Infection, Genetics and Evolution 5 May 2020, 104351
  … COVID-19 の流行は 2019年10月~12月に始まったのではないかとの推測。
 ● GISAID
 ● GenBank Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate Wuhan-Hu-1, complete genome

動物モデル

 ● 【プレプリント】Rapid adaptation of SARS-CoV-2 in BALB/c mice: Novel mouse model for vaccine efficacy
  … BALB/c mice への馴化によるモデル化。

環境での耐性など

 ● Aerosol and Surface Stability of SARS-CoV-2 as Compared with SARS-CoV-1.
  N Engl J Med 2020; 382:1564-1567. DOI: 10.1056/NEJMc2004973
  … 環境中における SARS-CoV-2 の活性維持の検討報告。
 ● Inactivation of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 by WHO-Recommended Hand Rub Formulations and Alcohols
  Emerg Infect Dis. 2020 Jul. https://doi.org/10.3201/eid2607.200915

解説・報道

 ● ウイルスの高病原化、確認できず 2タイプ併存否定―英大学
  時事通信 2020.5.10
 ● Coronavirus mutations: Scientists puzzle over impact
  BBC 2020.5.6
 ● Bad News Wrapped in Protein: Inside the Coronavirus Genome
  The New York Times 2020.4.3
  … 新型コロナウイルス SARS-CoV-2 のもつたんぱく質について
   非常によくまとまった記事。
 ● There is one, and only one strain of SARS-CoV-2
  Virology blog 2020.5.7
  … 様々な変異による「型」をいうものがあるが、新型コロナウイルス
   SARS-CoV-2は今のところ一つの「型」しかないという話。

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