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新型コロナウイルスのウイルス学的な研究について
● Virological assessment of hospitalized patients with COVID-2019
Nature Published: 01 April 2020
… Extended data に抗体についての挙動（他のコロナウイルスとの交差性
を示すもの）もあり。
● Site-specific glycan analysis of the SARS-CoV-2 spike
Science 04 May 2020: eabb9983 DOI: 10.1126/science.abb9983
… Sタンパクの糖鎖付加についての解析。
変異について
2020年12月、イギリスにおいて変異ウイルス B.1.1.7 （20B/501Y.V1 Variant of Concern (VOC) 202012/01）の拡大があるとのイギリス政府からの発表がありました。また、南アフリカでも変異ウイルス（B.1.351 lineage (20C/501Y.V2)）の拡大がみられると当局によって発表がされています。B.1.1.7 および他の変異についてここでまとめます。
B.1.1.7 (20B/501Y.V1 Variant of Concern (VOC) 202012/01) について
● 英国で検出された新型コロナの変異株 日本への影響は？どの程度恐れるべき？
… Yahoo!ニュース個人 峰 宗太郎 2020.12.24
● イギリスの新型コロナ変異ウイルスは何が問題なのか
… Yahoo!ニュース個人 忽那 賢志 2020.12.21
● イギリスと南アフリカ、それぞれの新型コロナ変異種の現在の状況は？
… Yahoo!ニュース個人 忽那 賢志 2020.12.27
● 英国と世界がコロナ変異株に警戒する理由
… Yahoo!ニュース個人 小野 昌弘 2020.12.26
● コロナ変異株にワクチンは効くのか
… Yahoo!ニュース個人 小野 昌弘 2020.12.27
● 国立感染症研究所 感染性の増加が懸念されるSARS-CoV-2新規変異株について （第4報）
● WHO SARS-CoV-2 Variants
● CDC Emerging SARS-CoV-2 Variants
● ECDC Risk related to spread of new SARSCoV-2 variants of concern in the EU/EEA
● イギリス政府 Investigation of novel SARS-COV-2 variant: Variant of Concern 202012/01
● イギリス NERVTAG
● Transmission of SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.7 in England: Insights from linking epidemiological and genetic data
… インペリアルカレッジロンドンのファーガソン博士のグループからの報告
● Estimated transmissibility and severity of novel SARS-CoV-2 Variant of Concern 202012/01 in England
… B.1.1.7 の感染のしやすさについて推定したプレプリント
●【報道】NYT Coronavirus Variant Is Indeed More Transmissible, New Study Suggests
●【報道】Vox The new UK coronavirus mutations, explained
B.1.351 lineage (20C/501Y.V2) について
● 南アフリカ COVID-19 ポータル
D614G 変異について
● No evidence for increased transmissibility from recurrent mutations in SARS-CoV-2
… Nature Communications volume 11, Article number: 5986 (2020)
D614G 変異も含む繰り返し現れる変異によってヒト集団での
感染性増加は明らかではないという報告
● SARS-CoV-2 D614G variant exhibits efficient replication ex vivo and transmission in vivo
… Science 18 Dec 2020: Vol. 370, Issue 6523, pp. 1464-1468
DOI: 10.1126/science.abe8499
D614G 変異のあるウイルスは効率よく増殖し、
動物モデルで感染しやすさが増すとの報告
● Tracking Changes in SARS-CoV-2 Spike: Evidence that D614G Increases Infectivity of the COVID-19 Virus
… Cell July 02, 2020
DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.043
D614G 変異によって感染性が変わるとの報告
他の変異について
● Emerging SARS-CoV-2 mutation hot spots include a novel RNA-dependent-RNA polymerase variant
Journal of Translational Medicine volume 18, Article number: 179 (2020)
… 変異しやすい部位には RdRp も含まれているという報告。
ウイルス-宿主関係
● Functional assessment of cell entry and receptor usage for SARS-CoV-2 and other lineage B betacoronaviruses
Nature Microbiology volume 5, pages 562–569(2020)
… SARS-CoV-2 の受容体は ACE2 であるという解析。
● SARS-CoV-2 entry factors are highly expressed in nasal epithelial cells together with innate immune genes
Nature Medicine volume 26, pages681–687(2020)
遺伝学的研究
● Emergence of genomic diversity and recurrent mutations in SARS-CoV-2
Infection, Genetics and Evolution Available online 5 May 2020, 104351
… SARS-CoV-2 の遺伝変異について。
● No evidence for distinct types in the evolution of SARS-CoV-2
Virus Evolution, veaa034, https://doi.org/10.1093/ve/veaa034
… ウイルスのタイプは特に分かれていないという検討。
● 新型コロナウイルスSARS-CoV-2のゲノム分子疫学調査
国立感染症研究所 2020.4.27
● Phylogenetic analysis of nCoV-2019 genomes
● Emergence of genomic diversity and recurrent mutations in SARS-CoV-2
Infection, Genetics and Evolution 5 May 2020, 104351
… COVID-19 の流行は 2019年10月～12月に始まったのではないかとの推測。
● GISAID
● GenBank Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate Wuhan-Hu-1, complete genome
動物モデル
● 【プレプリント】Rapid adaptation of SARS-CoV-2 in BALB/c mice: Novel mouse model for vaccine efficacy
… BALB/c mice への馴化によるモデル化。
環境での耐性など
● Aerosol and Surface Stability of SARS-CoV-2 as Compared with SARS-CoV-1.
N Engl J Med 2020; 382:1564-1567. DOI: 10.1056/NEJMc2004973
… 環境中における SARS-CoV-2 の活性維持の検討報告。
● Inactivation of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 by WHO-Recommended Hand Rub Formulations and Alcohols
Emerg Infect Dis. 2020 Jul. https://doi.org/10.3201/eid2607.200915
解説・報道
● ウイルスの高病原化、確認できず ２タイプ併存否定―英大学
時事通信 2020.5.10
● Coronavirus mutations: Scientists puzzle over impact
BBC 2020.5.6
● Bad News Wrapped in Protein: Inside the Coronavirus Genome
The New York Times 2020.4.3
… 新型コロナウイルス SARS-CoV-2 のもつたんぱく質について
非常によくまとまった記事。
● There is one, and only one strain of SARS-CoV-2
Virology blog 2020.5.7
… 様々な変異による「型」をいうものがあるが、新型コロナウイルス
SARS-CoV-2は今のところ一つの「型」しかないという話。